Закройте клиент Transmission. Обратитесь к файлу настроек Transmission settings.json, который расположен в скрытом каталоге .config/transmission Вашего домашнего каталога. Или откройте этот файл в текстовом редакторе через команду терминала:
xed /home/user/.config/transmission/settings.json
user – приводимый как пример домашний каталог пользователя с логином user
Найдите строку, которая указывает на ширину окна, "main-window-width": и измените после двоеточия цифру, указывающую размер окна в пикселях.
Например, после добавления одного из торрентов это значение у меня составило 1198. После его изменения на 620 в моём случае Transmission запустился с приемлемой для меня шириной окна.